Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN2Q02246 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms