Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms