Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UFM1P61960 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UFM1P61960 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UFM1P61960 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UFM1P61960 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UFM1P61960 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UFM1P61960 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UFM1P61960 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UFM1P61960 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UFM1P61960 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UFM1P61960 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
UFM1P61960 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UFM1P61960 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UFM1P61960 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UFM1P61960 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UFM1P61960 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
UFM1P61960 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
UFM1P61960 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UFM1P61960 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UFM1P61960 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UFM1P61960 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UFM1P61960 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UFM1P61960 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UFM1P61960 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
UFM1P61960 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UFM1P61960 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UFM1P61960 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
UFM1P61960 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
UFM1P61960 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UFM1P61960 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UFM1P61960 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UFM1P61960 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UFM1P61960 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UFM1P61960 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UFM1P61960 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UFM1P61960 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UFM1P61960 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UFM1P61960 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UFM1P61960 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UFM1P61960 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UFM1P61960 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UFM1P61960 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UFM1P61960 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UFM1P61960 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UFM1P61960 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
UFM1P61960 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UFM1P61960 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UFM1P61960 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UFM1P61960 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UFM1P61960 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UFM1P61960 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UFM1P61960 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UFM1P61960 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UFM1P61960 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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