Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms