Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTBP60709 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTBP60709 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTBP60709 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTBP60709 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTBP60709 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTBP60709 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTBP60709 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTBP60709 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTBP60709 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTBP60709 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTBP60709 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTBP60709 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTBP60709 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTBP60709 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTBP60709 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTBP60709 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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ACTBP60709 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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ACTBP60709 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTBP60709 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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ACTBP60709 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTBP60709 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTBP60709 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTBP60709 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTBP60709 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTBP60709 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTBP60709 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTBP60709 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTBP60709 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTBP60709 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTBP60709 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTBP60709 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTBP60709 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTBP60709 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTBP60709 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTBP60709 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTBP60709 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTBP60709 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTBP60709 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTBP60709 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTBP60709 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTBP60709 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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