Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIRAP54198 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HIRAP54198 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIRAP54198 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIRAP54198 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIRAP54198 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIRAP54198 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIRAP54198 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIRAP54198 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIRAP54198 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HIRAP54198 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HIRAP54198 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIRAP54198 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIRAP54198 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIRAP54198 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIRAP54198 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIRAP54198 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIRAP54198 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIRAP54198 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIRAP54198 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIRAP54198 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIRAP54198 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIRAP54198 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIRAP54198 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIRAP54198 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIRAP54198 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIRAP54198 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIRAP54198 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIRAP54198 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIRAP54198 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIRAP54198 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIRAP54198 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIRAP54198 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIRAP54198 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIRAP54198 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIRAP54198 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIRAP54198 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIRAP54198 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIRAP54198 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIRAP54198 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIRAP54198 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIRAP54198 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIRAP54198 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIRAP54198 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HIRAP54198 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIRAP54198 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIRAP54198 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIRAP54198 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HIRAP54198 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIRAP54198 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HIRAP54198 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HIRAP54198 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIRAP54198 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIRAP54198 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIRAP54198 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIRAP54198 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIRAP54198 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIRAP54198 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIRAP54198 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIRAP54198 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIRAP54198 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIRAP54198 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIRAP54198 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIRAP54198 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIRAP54198 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIRAP54198 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIRAP54198 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIRAP54198 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIRAP54198 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIRAP54198 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIRAP54198 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIRAP54198 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIRAP54198 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIRAP54198 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HIRAP54198 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIRAP54198 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIRAP54198 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIRAP54198 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIRAP54198 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIRAP54198 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIRAP54198 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HIRAP54198 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIRAP54198 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIRAP54198 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HIRAP54198 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIRAP54198 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIRAP54198 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIRAP54198 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIRAP54198 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIRAP54198 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIRAP54198 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIRAP54198 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIRAP54198 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HIRAP54198 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIRAP54198 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIRAP54198 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HIRAP54198 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HIRAP54198 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIRAP54198 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIRAP54198 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms