Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
POLR2KP53803 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 298.6 ms