Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FOSBP53539 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOSBP53539 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOSBP53539 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOSBP53539 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOSBP53539 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOSBP53539 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOSBP53539 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOSBP53539 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOSBP53539 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOSBP53539 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOSBP53539 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOSBP53539 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOSBP53539 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOSBP53539 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOSBP53539 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOSBP53539 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOSBP53539 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOSBP53539 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOSBP53539 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FOSBP53539 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOSBP53539 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOSBP53539 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOSBP53539 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOSBP53539 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOSBP53539 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOSBP53539 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FOSBP53539 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOSBP53539 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOSBP53539 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOSBP53539 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOSBP53539 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOSBP53539 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOSBP53539 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOSBP53539 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOSBP53539 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOSBP53539 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOSBP53539 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FOSBP53539 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
FOSBP53539 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
FOSBP53539 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOSBP53539 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOSBP53539 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOSBP53539 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOSBP53539 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOSBP53539 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOSBP53539 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOSBP53539 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOSBP53539 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FOSBP53539 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOSBP53539 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOSBP53539 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOSBP53539 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOSBP53539 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOSBP53539 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOSBP53539 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOSBP53539 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOSBP53539 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOSBP53539 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOSBP53539 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOSBP53539 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOSBP53539 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOSBP53539 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms