Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERFP50548 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERFP50548 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERFP50548 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ERFP50548 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERFP50548 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ERFP50548 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERFP50548 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERFP50548 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERFP50548 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERFP50548 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERFP50548 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERFP50548 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERFP50548 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERFP50548 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERFP50548 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ERFP50548 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERFP50548 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ERFP50548 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERFP50548 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERFP50548 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERFP50548 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERFP50548 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERFP50548 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERFP50548 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERFP50548 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERFP50548 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERFP50548 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERFP50548 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERFP50548 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERFP50548 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERFP50548 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERFP50548 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERFP50548 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERFP50548 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERFP50548 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERFP50548 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERFP50548 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERFP50548 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERFP50548 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERFP50548 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERFP50548 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERFP50548 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERFP50548 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERFP50548 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERFP50548 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERFP50548 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERFP50548 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERFP50548 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERFP50548 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERFP50548 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERFP50548 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERFP50548 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERFP50548 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERFP50548 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERFP50548 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERFP50548 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERFP50548 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERFP50548 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERFP50548 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERFP50548 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERFP50548 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERFP50548 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERFP50548 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERFP50548 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERFP50548 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERFP50548 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERFP50548 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERFP50548 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERFP50548 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERFP50548 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERFP50548 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERFP50548 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms