Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP5P45974 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP5P45974 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP5P45974 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP5P45974 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP5P45974 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP5P45974 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP5P45974 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP5P45974 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP5P45974 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP5P45974 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP5P45974 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP5P45974 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP5P45974 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP5P45974 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP5P45974 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP5P45974 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP5P45974 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP5P45974 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP5P45974 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP5P45974 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP5P45974 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP5P45974 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP5P45974 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP5P45974 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP5P45974 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP5P45974 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP5P45974 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP5P45974 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP5P45974 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP5P45974 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP5P45974 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP5P45974 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP5P45974 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP5P45974 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP5P45974 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP5P45974 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP5P45974 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP5P45974 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP5P45974 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP5P45974 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP5P45974 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP5P45974 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP5P45974 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP5P45974 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP5P45974 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP5P45974 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP5P45974 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP5P45974 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP5P45974 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP5P45974 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP5P45974 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP5P45974 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP5P45974 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP5P45974 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP5P45974 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP5P45974 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP5P45974 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP5P45974 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP5P45974 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP5P45974 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP5P45974 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP5P45974 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP5P45974 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms