Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms