Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms