Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTGER1P34995 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTGER1P34995 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTGER1P34995 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTGER1P34995 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTGER1P34995 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTGER1P34995 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTGER1P34995 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTGER1P34995 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTGER1P34995 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTGER1P34995 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTGER1P34995 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTGER1P34995 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTGER1P34995 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTGER1P34995 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTGER1P34995 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTGER1P34995 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTGER1P34995 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTGER1P34995 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTGER1P34995 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTGER1P34995 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTGER1P34995 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTGER1P34995 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTGER1P34995 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTGER1P34995 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTGER1P34995 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTGER1P34995 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTGER1P34995 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTGER1P34995 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTGER1P34995 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTGER1P34995 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTGER1P34995 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTGER1P34995 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTGER1P34995 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTGER1P34995 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PTGER1P34995 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTGER1P34995 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTGER1P34995 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTGER1P34995 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTGER1P34995 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTGER1P34995 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTGER1P34995 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTGER1P34995 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTGER1P34995 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms