Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms