Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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CRABP1P29762 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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CRABP1P29762 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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CRABP1P29762 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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CRABP1P29762 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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CRABP1P29762 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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CRABP1P29762 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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CRABP1P29762 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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CRABP1P29762 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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