Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms