Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC5P28715 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms