Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms