Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PLNP26678 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PLNP26678 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PLNP26678 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PLNP26678 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PLNP26678 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PLNP26678 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PLNP26678 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PLNP26678 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PLNP26678 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PLNP26678 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PLNP26678 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms