Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO1P25800 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO1P25800 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO1P25800 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO1P25800 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO1P25800 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO1P25800 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO1P25800 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO1P25800 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO1P25800 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO1P25800 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO1P25800 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO1P25800 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO1P25800 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO1P25800 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO1P25800 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO1P25800 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO1P25800 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO1P25800 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO1P25800 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO1P25800 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO1P25800 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO1P25800 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO1P25800 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO1P25800 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO1P25800 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO1P25800 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO1P25800 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO1P25800 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO1P25800 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO1P25800 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO1P25800 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO1P25800 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO1P25800 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO1P25800 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO1P25800 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO1P25800 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO1P25800 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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