Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP11P24347 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP11P24347 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP11P24347 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP11P24347 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP11P24347 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP11P24347 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP11P24347 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP11P24347 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP11P24347 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP11P24347 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP11P24347 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP11P24347 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP11P24347 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP11P24347 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP11P24347 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP11P24347 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP11P24347 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP11P24347 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP11P24347 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP11P24347 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP11P24347 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP11P24347 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP11P24347 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP11P24347 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP11P24347 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP11P24347 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP11P24347 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP11P24347 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP11P24347 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP11P24347 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP11P24347 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP11P24347 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP11P24347 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP11P24347 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP11P24347 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP11P24347 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP11P24347 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP11P24347 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP11P24347 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP11P24347 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP11P24347 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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MMP11P24347 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP11P24347 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP11P24347 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP11P24347 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP11P24347 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP11P24347 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP11P24347 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP11P24347 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP11P24347 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP11P24347 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP11P24347 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP11P24347 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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MMP11P24347 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP11P24347 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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MMP11P24347 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP11P24347 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP11P24347 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP11P24347 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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MMP11P24347 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP11P24347 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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MMP11P24347 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP11P24347 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP11P24347 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP11P24347 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP11P24347 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP11P24347 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP11P24347 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP11P24347 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP11P24347 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP11P24347 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP11P24347 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP11P24347 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP11P24347 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP11P24347 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP11P24347 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP11P24347 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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