Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNNT1P13805 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms