Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms