Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms