Protein–RNA interactions for Protein: P07988

SFTPB, Pulmonary surfactant-associated protein B, humanhuman

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPBP07988 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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