Protein–RNA interactions for Protein: P02655

APOC2, Apolipoprotein C-II, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC2P02655 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC2P02655 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC2P02655 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC2P02655 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC2P02655 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC2P02655 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC2P02655 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC2P02655 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC2P02655 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC2P02655 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC2P02655 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC2P02655 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC2P02655 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC2P02655 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC2P02655 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC2P02655 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC2P02655 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC2P02655 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC2P02655 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC2P02655 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC2P02655 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC2P02655 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC2P02655 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC2P02655 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC2P02655 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC2P02655 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC2P02655 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC2P02655 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC2P02655 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC2P02655 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC2P02655 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC2P02655 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC2P02655 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC2P02655 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC2P02655 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC2P02655 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC2P02655 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC2P02655 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC2P02655 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC2P02655 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC2P02655 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC2P02655 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC2P02655 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC2P02655 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC2P02655 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC2P02655 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC2P02655 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC2P02655 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC2P02655 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC2P02655 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC2P02655 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC2P02655 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC2P02655 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC2P02655 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC2P02655 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC2P02655 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC2P02655 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC2P02655 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC2P02655 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC2P02655 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC2P02655 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC2P02655 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC2P02655 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC2P02655 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC2P02655 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC2P02655 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC2P02655 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC2P02655 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC2P02655 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC2P02655 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC2P02655 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC2P02655 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC2P02655 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC2P02655 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC2P02655 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC2P02655 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC2P02655 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC2P02655 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC2P02655 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC2P02655 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC2P02655 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC2P02655 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC2P02655 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC2P02655 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC2P02655 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC2P02655 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC2P02655 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC2P02655 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC2P02655 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC2P02655 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC2P02655 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC2P02655 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC2P02655 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC2P02655 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC2P02655 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC2P02655 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC2P02655 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC2P02655 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC2P02655 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC2P02655 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms