Protein–RNA interactions for Protein: O95389

WISP3, WNT1-inducible-signaling pathway protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WISP3O95389 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WISP3O95389 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WISP3O95389 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
WISP3O95389 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
WISP3O95389 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
WISP3O95389 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WISP3O95389 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
WISP3O95389 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WISP3O95389 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
WISP3O95389 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WISP3O95389 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WISP3O95389 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WISP3O95389 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WISP3O95389 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
WISP3O95389 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
WISP3O95389 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
WISP3O95389 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WISP3O95389 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
WISP3O95389 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
WISP3O95389 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
WISP3O95389 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
WISP3O95389 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
WISP3O95389 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
WISP3O95389 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
WISP3O95389 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WISP3O95389 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WISP3O95389 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
WISP3O95389 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
WISP3O95389 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
WISP3O95389 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
WISP3O95389 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WISP3O95389 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
WISP3O95389 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
WISP3O95389 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
WISP3O95389 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.08■□□□□ 0
WISP3O95389 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WISP3O95389 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
WISP3O95389 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.08■□□□□ 0
WISP3O95389 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
WISP3O95389 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.08■□□□□ 0
WISP3O95389 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
WISP3O95389 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.08■□□□□ 0
WISP3O95389 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
WISP3O95389 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WISP3O95389 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
WISP3O95389 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
WISP3O95389 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
WISP3O95389 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
WISP3O95389 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WISP3O95389 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WISP3O95389 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WISP3O95389 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WISP3O95389 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WISP3O95389 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WISP3O95389 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WISP3O95389 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
WISP3O95389 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WISP3O95389 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WISP3O95389 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WISP3O95389 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WISP3O95389 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
WISP3O95389 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
WISP3O95389 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WISP3O95389 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
WISP3O95389 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WISP3O95389 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
WISP3O95389 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
WISP3O95389 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
WISP3O95389 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WISP3O95389 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WISP3O95389 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WISP3O95389 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
WISP3O95389 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
WISP3O95389 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WISP3O95389 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
WISP3O95389 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WISP3O95389 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
WISP3O95389 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WISP3O95389 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
WISP3O95389 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
WISP3O95389 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WISP3O95389 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
WISP3O95389 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
WISP3O95389 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WISP3O95389 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
WISP3O95389 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
WISP3O95389 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
WISP3O95389 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
WISP3O95389 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
WISP3O95389 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
WISP3O95389 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WISP3O95389 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
WISP3O95389 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
WISP3O95389 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WISP3O95389 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WISP3O95389 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WISP3O95389 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
WISP3O95389 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WISP3O95389 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WISP3O95389 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms