Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms