Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms