Protein–RNA interactions for Protein: O60941

DTNB, Dystrobrevin beta, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTNBO60941 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTNBO60941 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTNBO60941 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTNBO60941 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTNBO60941 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DTNBO60941 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DTNBO60941 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DTNBO60941 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTNBO60941 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DTNBO60941 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DTNBO60941 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTNBO60941 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTNBO60941 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTNBO60941 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DTNBO60941 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTNBO60941 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DTNBO60941 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTNBO60941 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTNBO60941 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTNBO60941 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTNBO60941 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DTNBO60941 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTNBO60941 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTNBO60941 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTNBO60941 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTNBO60941 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTNBO60941 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTNBO60941 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTNBO60941 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTNBO60941 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTNBO60941 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTNBO60941 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTNBO60941 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTNBO60941 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTNBO60941 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTNBO60941 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTNBO60941 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTNBO60941 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTNBO60941 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DTNBO60941 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTNBO60941 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTNBO60941 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTNBO60941 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTNBO60941 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms