Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms