Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRC1O43663 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRC1O43663 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRC1O43663 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRC1O43663 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRC1O43663 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRC1O43663 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PRC1O43663 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRC1O43663 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRC1O43663 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRC1O43663 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRC1O43663 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRC1O43663 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRC1O43663 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRC1O43663 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRC1O43663 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRC1O43663 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRC1O43663 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRC1O43663 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRC1O43663 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRC1O43663 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRC1O43663 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PRC1O43663 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRC1O43663 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PRC1O43663 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRC1O43663 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRC1O43663 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRC1O43663 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRC1O43663 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRC1O43663 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRC1O43663 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRC1O43663 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRC1O43663 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRC1O43663 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRC1O43663 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRC1O43663 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRC1O43663 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRC1O43663 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRC1O43663 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRC1O43663 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRC1O43663 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRC1O43663 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRC1O43663 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRC1O43663 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRC1O43663 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRC1O43663 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRC1O43663 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRC1O43663 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRC1O43663 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRC1O43663 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRC1O43663 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRC1O43663 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRC1O43663 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRC1O43663 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRC1O43663 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRC1O43663 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRC1O43663 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRC1O43663 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRC1O43663 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRC1O43663 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRC1O43663 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRC1O43663 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRC1O43663 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRC1O43663 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRC1O43663 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRC1O43663 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRC1O43663 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRC1O43663 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRC1O43663 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRC1O43663 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRC1O43663 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRC1O43663 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRC1O43663 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRC1O43663 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRC1O43663 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRC1O43663 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRC1O43663 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRC1O43663 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRC1O43663 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRC1O43663 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRC1O43663 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRC1O43663 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRC1O43663 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRC1O43663 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRC1O43663 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRC1O43663 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRC1O43663 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRC1O43663 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRC1O43663 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRC1O43663 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRC1O43663 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRC1O43663 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRC1O43663 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRC1O43663 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRC1O43663 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRC1O43663 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRC1O43663 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRC1O43663 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRC1O43663 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRC1O43663 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms