Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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