Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBDO15205 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBDO15205 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBDO15205 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBDO15205 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBDO15205 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBDO15205 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBDO15205 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBDO15205 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBDO15205 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
UBDO15205 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBDO15205 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBDO15205 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
UBDO15205 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBDO15205 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UBDO15205 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBDO15205 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBDO15205 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBDO15205 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBDO15205 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBDO15205 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBDO15205 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBDO15205 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBDO15205 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBDO15205 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBDO15205 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBDO15205 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBDO15205 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBDO15205 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBDO15205 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBDO15205 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBDO15205 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBDO15205 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBDO15205 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBDO15205 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBDO15205 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBDO15205 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBDO15205 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBDO15205 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBDO15205 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBDO15205 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBDO15205 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBDO15205 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBDO15205 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBDO15205 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBDO15205 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBDO15205 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBDO15205 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBDO15205 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBDO15205 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBDO15205 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBDO15205 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBDO15205 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
UBDO15205 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBDO15205 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
UBDO15205 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBDO15205 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
UBDO15205 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBDO15205 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBDO15205 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
UBDO15205 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBDO15205 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBDO15205 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBDO15205 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBDO15205 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBDO15205 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBDO15205 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBDO15205 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBDO15205 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBDO15205 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBDO15205 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBDO15205 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBDO15205 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBDO15205 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBDO15205 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBDO15205 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBDO15205 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBDO15205 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBDO15205 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBDO15205 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBDO15205 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBDO15205 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms