Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms