Protein–RNA interactions for Protein: A6NGA9

TMEM202, Transmembrane protein 202, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM202A6NGA9 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms