Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms