Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y8

SEC23IP, SEC23-interacting protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,000 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23IPQ9Y6Y8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC23IPQ9Y6Y8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC23IPQ9Y6Y8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC23IPQ9Y6Y8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC23IPQ9Y6Y8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC23IPQ9Y6Y8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC23IPQ9Y6Y8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC23IPQ9Y6Y8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC23IPQ9Y6Y8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC23IPQ9Y6Y8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC23IPQ9Y6Y8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC23IPQ9Y6Y8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC23IPQ9Y6Y8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC23IPQ9Y6Y8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC23IPQ9Y6Y8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC23IPQ9Y6Y8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC23IPQ9Y6Y8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC23IPQ9Y6Y8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC23IPQ9Y6Y8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC23IPQ9Y6Y8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC23IPQ9Y6Y8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC23IPQ9Y6Y8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC23IPQ9Y6Y8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC23IPQ9Y6Y8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC23IPQ9Y6Y8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC23IPQ9Y6Y8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC23IPQ9Y6Y8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC23IPQ9Y6Y8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC23IPQ9Y6Y8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC23IPQ9Y6Y8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC23IPQ9Y6Y8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC23IPQ9Y6Y8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC23IPQ9Y6Y8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC23IPQ9Y6Y8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC23IPQ9Y6Y8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC23IPQ9Y6Y8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC23IPQ9Y6Y8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC23IPQ9Y6Y8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC23IPQ9Y6Y8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC23IPQ9Y6Y8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC23IPQ9Y6Y8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC23IPQ9Y6Y8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC23IPQ9Y6Y8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC23IPQ9Y6Y8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms