Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G9

DYNC1LI1, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI1Q9Y6G9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DYNC1LI1Q9Y6G9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DYNC1LI1Q9Y6G9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms