Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PARP3Q9Y6F1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PARP3Q9Y6F1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PARP3Q9Y6F1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PARP3Q9Y6F1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PARP3Q9Y6F1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PARP3Q9Y6F1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PARP3Q9Y6F1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PARP3Q9Y6F1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PARP3Q9Y6F1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PARP3Q9Y6F1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PARP3Q9Y6F1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PARP3Q9Y6F1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PARP3Q9Y6F1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PARP3Q9Y6F1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PARP3Q9Y6F1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PARP3Q9Y6F1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PARP3Q9Y6F1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PARP3Q9Y6F1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PARP3Q9Y6F1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PARP3Q9Y6F1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PARP3Q9Y6F1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PARP3Q9Y6F1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PARP3Q9Y6F1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PARP3Q9Y6F1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PARP3Q9Y6F1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PARP3Q9Y6F1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PARP3Q9Y6F1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PARP3Q9Y6F1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PARP3Q9Y6F1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PARP3Q9Y6F1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PARP3Q9Y6F1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PARP3Q9Y6F1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PARP3Q9Y6F1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PARP3Q9Y6F1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PARP3Q9Y6F1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PARP3Q9Y6F1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PARP3Q9Y6F1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PARP3Q9Y6F1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PARP3Q9Y6F1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PARP3Q9Y6F1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PARP3Q9Y6F1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PARP3Q9Y6F1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PARP3Q9Y6F1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PARP3Q9Y6F1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PARP3Q9Y6F1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PARP3Q9Y6F1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PARP3Q9Y6F1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PARP3Q9Y6F1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PARP3Q9Y6F1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PARP3Q9Y6F1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PARP3Q9Y6F1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PARP3Q9Y6F1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PARP3Q9Y6F1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PARP3Q9Y6F1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PARP3Q9Y6F1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PARP3Q9Y6F1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PARP3Q9Y6F1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PARP3Q9Y6F1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PARP3Q9Y6F1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PARP3Q9Y6F1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PARP3Q9Y6F1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PARP3Q9Y6F1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PARP3Q9Y6F1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PARP3Q9Y6F1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PARP3Q9Y6F1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PARP3Q9Y6F1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PARP3Q9Y6F1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PARP3Q9Y6F1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PARP3Q9Y6F1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PARP3Q9Y6F1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PARP3Q9Y6F1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PARP3Q9Y6F1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PARP3Q9Y6F1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PARP3Q9Y6F1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PARP3Q9Y6F1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PARP3Q9Y6F1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PARP3Q9Y6F1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PARP3Q9Y6F1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PARP3Q9Y6F1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PARP3Q9Y6F1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PARP3Q9Y6F1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PARP3Q9Y6F1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PARP3Q9Y6F1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PARP3Q9Y6F1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PARP3Q9Y6F1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PARP3Q9Y6F1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PARP3Q9Y6F1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PARP3Q9Y6F1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PARP3Q9Y6F1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PARP3Q9Y6F1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PARP3Q9Y6F1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PARP3Q9Y6F1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PARP3Q9Y6F1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PARP3Q9Y6F1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PARP3Q9Y6F1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PARP3Q9Y6F1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PARP3Q9Y6F1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PARP3Q9Y6F1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PARP3Q9Y6F1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms