Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X4

NR2E3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2E3Q9Y5X4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NR2E3Q9Y5X4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NR2E3Q9Y5X4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NR2E3Q9Y5X4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NR2E3Q9Y5X4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NR2E3Q9Y5X4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NR2E3Q9Y5X4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NR2E3Q9Y5X4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NR2E3Q9Y5X4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NR2E3Q9Y5X4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NR2E3Q9Y5X4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NR2E3Q9Y5X4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NR2E3Q9Y5X4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NR2E3Q9Y5X4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NR2E3Q9Y5X4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NR2E3Q9Y5X4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
NR2E3Q9Y5X4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NR2E3Q9Y5X4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms