Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX9Q9Y5X1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SNX9Q9Y5X1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX9Q9Y5X1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX9Q9Y5X1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX9Q9Y5X1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX9Q9Y5X1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX9Q9Y5X1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX9Q9Y5X1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX9Q9Y5X1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX9Q9Y5X1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX9Q9Y5X1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX9Q9Y5X1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX9Q9Y5X1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX9Q9Y5X1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX9Q9Y5X1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms