Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CD2APQ9Y5K6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CD2APQ9Y5K6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CD2APQ9Y5K6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CD2APQ9Y5K6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CD2APQ9Y5K6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CD2APQ9Y5K6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CD2APQ9Y5K6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CD2APQ9Y5K6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CD2APQ9Y5K6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CD2APQ9Y5K6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CD2APQ9Y5K6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CD2APQ9Y5K6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CD2APQ9Y5K6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CD2APQ9Y5K6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CD2APQ9Y5K6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CD2APQ9Y5K6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CD2APQ9Y5K6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CD2APQ9Y5K6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CD2APQ9Y5K6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CD2APQ9Y5K6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CD2APQ9Y5K6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CD2APQ9Y5K6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CD2APQ9Y5K6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CD2APQ9Y5K6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CD2APQ9Y5K6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CD2APQ9Y5K6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CD2APQ9Y5K6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CD2APQ9Y5K6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CD2APQ9Y5K6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CD2APQ9Y5K6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CD2APQ9Y5K6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CD2APQ9Y5K6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CD2APQ9Y5K6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CD2APQ9Y5K6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CD2APQ9Y5K6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CD2APQ9Y5K6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CD2APQ9Y5K6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CD2APQ9Y5K6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CD2APQ9Y5K6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CD2APQ9Y5K6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CD2APQ9Y5K6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CD2APQ9Y5K6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CD2APQ9Y5K6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CD2APQ9Y5K6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CD2APQ9Y5K6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CD2APQ9Y5K6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CD2APQ9Y5K6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CD2APQ9Y5K6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CD2APQ9Y5K6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CD2APQ9Y5K6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CD2APQ9Y5K6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CD2APQ9Y5K6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CD2APQ9Y5K6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CD2APQ9Y5K6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CD2APQ9Y5K6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CD2APQ9Y5K6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CD2APQ9Y5K6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CD2APQ9Y5K6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CD2APQ9Y5K6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CD2APQ9Y5K6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CD2APQ9Y5K6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CD2APQ9Y5K6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CD2APQ9Y5K6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CD2APQ9Y5K6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CD2APQ9Y5K6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CD2APQ9Y5K6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CD2APQ9Y5K6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CD2APQ9Y5K6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CD2APQ9Y5K6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CD2APQ9Y5K6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CD2APQ9Y5K6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CD2APQ9Y5K6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CD2APQ9Y5K6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CD2APQ9Y5K6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CD2APQ9Y5K6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CD2APQ9Y5K6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CD2APQ9Y5K6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CD2APQ9Y5K6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CD2APQ9Y5K6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CD2APQ9Y5K6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CD2APQ9Y5K6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CD2APQ9Y5K6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CD2APQ9Y5K6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CD2APQ9Y5K6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CD2APQ9Y5K6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CD2APQ9Y5K6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CD2APQ9Y5K6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CD2APQ9Y5K6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CD2APQ9Y5K6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CD2APQ9Y5K6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CD2APQ9Y5K6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CD2APQ9Y5K6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CD2APQ9Y5K6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CD2APQ9Y5K6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CD2APQ9Y5K6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CD2APQ9Y5K6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CD2APQ9Y5K6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CD2APQ9Y5K6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CD2APQ9Y5K6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms