Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K1

SPO11, Meiotic recombination protein SPO11, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPO11Q9Y5K1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPO11Q9Y5K1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPO11Q9Y5K1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPO11Q9Y5K1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPO11Q9Y5K1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SPO11Q9Y5K1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPO11Q9Y5K1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPO11Q9Y5K1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPO11Q9Y5K1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SPO11Q9Y5K1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPO11Q9Y5K1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPO11Q9Y5K1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPO11Q9Y5K1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPO11Q9Y5K1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPO11Q9Y5K1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPO11Q9Y5K1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPO11Q9Y5K1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPO11Q9Y5K1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SPO11Q9Y5K1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPO11Q9Y5K1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPO11Q9Y5K1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SPO11Q9Y5K1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPO11Q9Y5K1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPO11Q9Y5K1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPO11Q9Y5K1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPO11Q9Y5K1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPO11Q9Y5K1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPO11Q9Y5K1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPO11Q9Y5K1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPO11Q9Y5K1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPO11Q9Y5K1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPO11Q9Y5K1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPO11Q9Y5K1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPO11Q9Y5K1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPO11Q9Y5K1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPO11Q9Y5K1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPO11Q9Y5K1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPO11Q9Y5K1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPO11Q9Y5K1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPO11Q9Y5K1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPO11Q9Y5K1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPO11Q9Y5K1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPO11Q9Y5K1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPO11Q9Y5K1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPO11Q9Y5K1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPO11Q9Y5K1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPO11Q9Y5K1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPO11Q9Y5K1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPO11Q9Y5K1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPO11Q9Y5K1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPO11Q9Y5K1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPO11Q9Y5K1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms