Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHLDA3Q9Y5J5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PHLDA3Q9Y5J5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHLDA3Q9Y5J5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHLDA3Q9Y5J5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHLDA3Q9Y5J5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms