Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y548

YIPF1, Protein YIPF1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF1Q9Y548 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
YIPF1Q9Y548 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YIPF1Q9Y548 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
YIPF1Q9Y548 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
YIPF1Q9Y548 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YIPF1Q9Y548 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YIPF1Q9Y548 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
YIPF1Q9Y548 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YIPF1Q9Y548 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YIPF1Q9Y548 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YIPF1Q9Y548 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
YIPF1Q9Y548 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
YIPF1Q9Y548 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
YIPF1Q9Y548 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
YIPF1Q9Y548 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
YIPF1Q9Y548 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
YIPF1Q9Y548 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
YIPF1Q9Y548 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
YIPF1Q9Y548 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
YIPF1Q9Y548 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
YIPF1Q9Y548 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
YIPF1Q9Y548 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
YIPF1Q9Y548 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
YIPF1Q9Y548 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YIPF1Q9Y548 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YIPF1Q9Y548 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YIPF1Q9Y548 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
YIPF1Q9Y548 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
YIPF1Q9Y548 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
YIPF1Q9Y548 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YIPF1Q9Y548 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YIPF1Q9Y548 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
YIPF1Q9Y548 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
YIPF1Q9Y548 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
YIPF1Q9Y548 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
YIPF1Q9Y548 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
YIPF1Q9Y548 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
YIPF1Q9Y548 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
YIPF1Q9Y548 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
YIPF1Q9Y548 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
YIPF1Q9Y548 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
YIPF1Q9Y548 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
YIPF1Q9Y548 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
YIPF1Q9Y548 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
YIPF1Q9Y548 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
YIPF1Q9Y548 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
YIPF1Q9Y548 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
YIPF1Q9Y548 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
YIPF1Q9Y548 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
YIPF1Q9Y548 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
YIPF1Q9Y548 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
YIPF1Q9Y548 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
YIPF1Q9Y548 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
YIPF1Q9Y548 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
YIPF1Q9Y548 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
YIPF1Q9Y548 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
YIPF1Q9Y548 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
YIPF1Q9Y548 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YIPF1Q9Y548 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
YIPF1Q9Y548 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
YIPF1Q9Y548 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
YIPF1Q9Y548 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YIPF1Q9Y548 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
YIPF1Q9Y548 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
YIPF1Q9Y548 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
YIPF1Q9Y548 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
YIPF1Q9Y548 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
YIPF1Q9Y548 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
YIPF1Q9Y548 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
YIPF1Q9Y548 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
YIPF1Q9Y548 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
YIPF1Q9Y548 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
YIPF1Q9Y548 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
YIPF1Q9Y548 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
YIPF1Q9Y548 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
YIPF1Q9Y548 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
YIPF1Q9Y548 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
YIPF1Q9Y548 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
YIPF1Q9Y548 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
YIPF1Q9Y548 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
YIPF1Q9Y548 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
YIPF1Q9Y548 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
YIPF1Q9Y548 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
YIPF1Q9Y548 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
YIPF1Q9Y548 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
YIPF1Q9Y548 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
YIPF1Q9Y548 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
YIPF1Q9Y548 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
YIPF1Q9Y548 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
YIPF1Q9Y548 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
YIPF1Q9Y548 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
YIPF1Q9Y548 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
YIPF1Q9Y548 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
YIPF1Q9Y548 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
YIPF1Q9Y548 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
YIPF1Q9Y548 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
YIPF1Q9Y548 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
YIPF1Q9Y548 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
YIPF1Q9Y548 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
YIPF1Q9Y548 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms