Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKP3Q9Y446 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKP3Q9Y446 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PKP3Q9Y446 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKP3Q9Y446 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PKP3Q9Y446 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKP3Q9Y446 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKP3Q9Y446 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKP3Q9Y446 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKP3Q9Y446 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKP3Q9Y446 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKP3Q9Y446 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKP3Q9Y446 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKP3Q9Y446 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKP3Q9Y446 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKP3Q9Y446 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKP3Q9Y446 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKP3Q9Y446 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PKP3Q9Y446 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKP3Q9Y446 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKP3Q9Y446 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKP3Q9Y446 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKP3Q9Y446 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKP3Q9Y446 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKP3Q9Y446 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKP3Q9Y446 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PKP3Q9Y446 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKP3Q9Y446 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKP3Q9Y446 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKP3Q9Y446 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKP3Q9Y446 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKP3Q9Y446 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKP3Q9Y446 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKP3Q9Y446 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKP3Q9Y446 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKP3Q9Y446 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKP3Q9Y446 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKP3Q9Y446 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKP3Q9Y446 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKP3Q9Y446 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PKP3Q9Y446 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKP3Q9Y446 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKP3Q9Y446 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKP3Q9Y446 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKP3Q9Y446 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKP3Q9Y446 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKP3Q9Y446 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKP3Q9Y446 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKP3Q9Y446 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKP3Q9Y446 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKP3Q9Y446 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKP3Q9Y446 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKP3Q9Y446 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKP3Q9Y446 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKP3Q9Y446 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKP3Q9Y446 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKP3Q9Y446 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKP3Q9Y446 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKP3Q9Y446 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKP3Q9Y446 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKP3Q9Y446 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PKP3Q9Y446 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKP3Q9Y446 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKP3Q9Y446 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKP3Q9Y446 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKP3Q9Y446 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKP3Q9Y446 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKP3Q9Y446 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKP3Q9Y446 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKP3Q9Y446 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKP3Q9Y446 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKP3Q9Y446 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKP3Q9Y446 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKP3Q9Y446 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKP3Q9Y446 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKP3Q9Y446 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKP3Q9Y446 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKP3Q9Y446 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKP3Q9Y446 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKP3Q9Y446 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PKP3Q9Y446 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms