Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATF5Q9Y2D1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATF5Q9Y2D1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATF5Q9Y2D1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATF5Q9Y2D1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATF5Q9Y2D1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATF5Q9Y2D1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATF5Q9Y2D1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATF5Q9Y2D1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATF5Q9Y2D1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATF5Q9Y2D1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATF5Q9Y2D1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATF5Q9Y2D1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATF5Q9Y2D1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATF5Q9Y2D1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATF5Q9Y2D1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATF5Q9Y2D1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATF5Q9Y2D1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
ATF5Q9Y2D1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATF5Q9Y2D1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATF5Q9Y2D1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATF5Q9Y2D1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATF5Q9Y2D1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATF5Q9Y2D1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATF5Q9Y2D1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATF5Q9Y2D1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
ATF5Q9Y2D1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATF5Q9Y2D1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATF5Q9Y2D1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATF5Q9Y2D1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATF5Q9Y2D1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATF5Q9Y2D1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATF5Q9Y2D1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ATF5Q9Y2D1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATF5Q9Y2D1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATF5Q9Y2D1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATF5Q9Y2D1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATF5Q9Y2D1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATF5Q9Y2D1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ATF5Q9Y2D1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATF5Q9Y2D1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATF5Q9Y2D1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATF5Q9Y2D1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATF5Q9Y2D1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATF5Q9Y2D1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATF5Q9Y2D1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATF5Q9Y2D1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATF5Q9Y2D1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATF5Q9Y2D1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATF5Q9Y2D1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATF5Q9Y2D1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATF5Q9Y2D1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATF5Q9Y2D1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATF5Q9Y2D1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATF5Q9Y2D1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATF5Q9Y2D1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATF5Q9Y2D1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATF5Q9Y2D1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATF5Q9Y2D1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATF5Q9Y2D1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATF5Q9Y2D1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATF5Q9Y2D1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATF5Q9Y2D1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATF5Q9Y2D1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATF5Q9Y2D1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATF5Q9Y2D1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATF5Q9Y2D1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATF5Q9Y2D1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATF5Q9Y2D1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATF5Q9Y2D1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATF5Q9Y2D1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATF5Q9Y2D1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATF5Q9Y2D1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATF5Q9Y2D1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
ATF5Q9Y2D1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATF5Q9Y2D1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
ATF5Q9Y2D1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATF5Q9Y2D1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATF5Q9Y2D1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATF5Q9Y2D1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATF5Q9Y2D1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATF5Q9Y2D1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
ATF5Q9Y2D1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATF5Q9Y2D1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
ATF5Q9Y2D1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATF5Q9Y2D1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATF5Q9Y2D1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATF5Q9Y2D1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATF5Q9Y2D1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATF5Q9Y2D1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATF5Q9Y2D1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATF5Q9Y2D1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATF5Q9Y2D1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATF5Q9Y2D1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATF5Q9Y2D1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATF5Q9Y2D1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATF5Q9Y2D1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ATF5Q9Y2D1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATF5Q9Y2D1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATF5Q9Y2D1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms