Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y234

LIPT1, Lipoyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT1Q9Y234 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIPT1Q9Y234 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LIPT1Q9Y234 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LIPT1Q9Y234 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIPT1Q9Y234 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIPT1Q9Y234 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIPT1Q9Y234 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIPT1Q9Y234 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIPT1Q9Y234 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIPT1Q9Y234 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LIPT1Q9Y234 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIPT1Q9Y234 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIPT1Q9Y234 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIPT1Q9Y234 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIPT1Q9Y234 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIPT1Q9Y234 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIPT1Q9Y234 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIPT1Q9Y234 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIPT1Q9Y234 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIPT1Q9Y234 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LIPT1Q9Y234 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIPT1Q9Y234 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIPT1Q9Y234 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LIPT1Q9Y234 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIPT1Q9Y234 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIPT1Q9Y234 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIPT1Q9Y234 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIPT1Q9Y234 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIPT1Q9Y234 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIPT1Q9Y234 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIPT1Q9Y234 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIPT1Q9Y234 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms