Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GNEQ9Y223 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GNEQ9Y223 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GNEQ9Y223 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GNEQ9Y223 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GNEQ9Y223 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GNEQ9Y223 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GNEQ9Y223 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GNEQ9Y223 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GNEQ9Y223 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GNEQ9Y223 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GNEQ9Y223 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GNEQ9Y223 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GNEQ9Y223 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GNEQ9Y223 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GNEQ9Y223 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GNEQ9Y223 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GNEQ9Y223 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GNEQ9Y223 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GNEQ9Y223 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GNEQ9Y223 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GNEQ9Y223 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GNEQ9Y223 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GNEQ9Y223 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GNEQ9Y223 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GNEQ9Y223 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GNEQ9Y223 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GNEQ9Y223 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GNEQ9Y223 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GNEQ9Y223 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GNEQ9Y223 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GNEQ9Y223 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GNEQ9Y223 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GNEQ9Y223 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GNEQ9Y223 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GNEQ9Y223 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GNEQ9Y223 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GNEQ9Y223 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GNEQ9Y223 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GNEQ9Y223 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GNEQ9Y223 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GNEQ9Y223 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GNEQ9Y223 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GNEQ9Y223 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GNEQ9Y223 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms